boom5426/nature-paper-skills

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[!NOTE] 这是一个强约束的仓库，不是"通用论文写作技巧集合"。默认立场是 journal-first、claim-driven、证据边界优先；未明确 venue 时按 Nature 系列期刊导向处理。

✨ 特性

• 🎯 一图一主张：figure-planner 先定每张图的论点，nature-figure 出图，figure-style 查正确性
• 🧱 结构先于润色：先用 reverse outline 稳住证据链，再做句子级 scientific-prose-style
• 🔬 证据边界优先：Abstract / Introduction 不允许比下游证据更强
• 📊 统计与图注可审计：stats-reporting-audit 守住独立实验单元 n、多重比较、图注统计
• 📎 引用卫生：citation-verifier 本地扫描 + 严重度分级，先查后投
• 📦 可直接复制：每个 skill 自包含，脚本随目录分发，Codex 与 Claude Code 可并存

📦 快速开始

一条命令，不用克隆。脚本会自动识别你用的是 Codex 还是 Claude Code，装好推荐的 16 个 skill，并干净地覆盖旧版本。

curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Boom5426/Nature-Paper-Skills/main/install.sh | bash

装完后彻底重启 agent 让它加载新装的 skills（退出并重新打开 Claude Code 或 Codex，不是 /clear），再把这句话发过去：

用 paper-workflow 帮我判断这篇稿子下一步该用哪个 skill。

到这里就装完了，下面全是可选项。

[!TIP] 图形技能（nature-figure、figure-style）默认不在推荐安装集内，因为它们需要绘图后端（Python matplotlib / seaborn 或 R ggplot2）。nature-figure 的可选 AI 示意图路线另需 OPENROUTER_API_KEY，Python / R 绘图主路线不需要。加 --figure 即可安装。

🔄 默认工作流

flowchart TD
    A[paper-bootstrap] --> B[nature-portfolio-playbook]
    B --> C["scientific-writing / manuscript-optimizer"]
    C --> D[figure-planner]
    D --> E["nature-figure / figure-style"]
    E --> F[results-section-revision]
    F --> G[stats-reporting-audit]
    G --> H[citation-verifier]
    H --> H2[claim-source-verification]
    H2 --> I[data-availability]
    I --> J[scientific-prose-style]
    J --> K[submission-audit]
    K --> L[rebuttal-response]

工作流图中的 nature-figure / figure-style 属可选 Figure Stack，需按上方 TIP 额外安装。

写综述 / survey / perspective 时不走这条链：先用 review-article-architecture 立权威 plan，再用 draft-marker-discipline 建标记体系，压缩润色前先跑一次漂移审计。完整路径见 docs/workflow-map.md。

默认假设：

• 以期刊稿为主，不以会议稿为主
• 未明确 venue 时按 Nature 系列期刊导向处理
• 先修结构与证据链，再做语句级润色

🧩 仓库里有什么

核心技能 skills/core/

图形技能 skills/figure/

期刊定位技能 skills/venue/

研究与审稿技能 skills/research/ · skills/review/

可选技能 skills/optional/

🧭 设计原则

• claim-driven，而不是 panel-driven
• 一张主图尽量只承载一个主结论
• 图注是结果叙述的第二层，不是只解释坐标轴
• 主文只保留支撑本段 claim 的关键数字
• 对已有章节重写前，先做 reverse outline
• 不允许前半部分（Abstract / Introduction）比下游证据更强
• venue 与 article type 要前置决策，不要末期再救火
• 文献存在且元数据正确，不等于它支持那句话
• 权威文档高于好想法：冲突要提出，不能靠改稿子解决

详见 workflow-map · skill-map · venue-routing · design-principles。

📐 仓库结构

Nature-Paper-Skills/
├── docs/            # 工作流图、安装说明、设计参考
├── examples/        # 期望输出与 handoff 样例
├── skills/
│   ├── core/        # 默认期刊工作流
│   ├── figure/      # 图形生产与图形正确性
│   ├── venue/       # 期刊定位与政策
│   ├── research/    # 文献、分析、证据生成
│   ├── review/      # 审稿人视角评估
│   └── optional/    # 有用但非默认的扩展
├── install.sh       # Codex / Claude Code 一条命令安装脚本
├── ATTRIBUTION.md
├── CONTRIBUTING.md
├── README.md
└── README.en.md

脚本随 skill 目录分发，保证 skill 可独立复制和复用。

🎯 适用范围

🤝 贡献

贡献规范、命名约定和 PR 预期见 CONTRIBUTING.md。来源归因见 ATTRIBUTION.md。

🙏 致谢

本仓库部分代码和灵感来源于 OpenLAIR/dr-claw、罗小罗团队 Yuan1z0825/nature-skills 与 Claude Science skill pack，感谢所有为本项目贡献代码、文档和测试的开发者社区成员。逐项来源与许可见 ATTRIBUTION.md。

📄 许可

仓库自有内容为 MIT。部分 vendored skill（nature-figure、figure-style、scientific-prose-style、stats-reporting-audit 及若干合并片段）为 Apache-2.0，许可全文见 LICENSE-APACHE，覆盖范围见 NOTICE。