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神聖なバイオMCP - 同じフレームワークの下ですべてのあなたのお気に入りの薬用バイオツールを一緒に持ち込む
概要
神聖なバイオMCPは、私たちの実践的な経験からバイオx AI Hackathon-2025の間に生まれた統一されたフレームワークです。 , と . 当社の目標は、AI主導のIDE(Cursor、Windsurfなど)、チャットクライアント(Anthropic's Claude Desktopのような)にシームレスに統合し、複雑なエージェントワークフローのための基礎的なビルディングブロックとして機能することで、研究者にとってより簡単に人生を作ることです。 このプロジェクトでは、高度なバイオインフォマティクスと長寿研究のための単一の、凝集型エコシステムに複数の強力でスタンドアロンMCPサーバーを集約し、自律的な研究エージェントを構築します。 MCP は、大規模言語モデル (LLM) と専門ドメイン固有のツールとデータベースのギャップを埋めるプロトコルです。 AIアシスタントやエージェントが構造化されたタイプセーフなインターフェイスで複雑な機能にアクセスするための標準化された方法を提供します.
概要（AI 翻訳）
お問い合わせ
Bio x AI Hackathon 2025 開発中
ミッション
ホーリー・バイオ MCP は、バイオ x AI Hackathon-2025 で生まれた統一されたフレームワークです。当社の実践的な経験から、LLM の動力を与えられたエージェントをLongevity Genie プロジェクト、IBIMA(医学と老化研究におけるバイオ統計学および情報学のための構成)、およびAging Groupの**システム生物学。 当社の目標は、AI主導のIDE(Cursor、Windsurfなど)、チャットクライアント(Anthropic’s Claude Desktopのような)にシームレスに統合し、複雑なエージェントワークフローのための基礎的なビルディングブロックとして機能することで、研究者にとってより簡単に人生を作ることです。
このプロジェクトでは、高度なバイオインフォマティクスと長寿研究のための単一の、凝集型エコシステムに複数の強力でスタンドアローンMCPサーバーを集約します。** ネイティブな ElizaOSプラグインを含む** 自律的な研究エージェントを構築します。
モデルコンテキストプロトコル(MCP)とは?
MCP は、大規模言語モデル (LLM) と専門ドメイン固有のツールとデータベースのギャップを埋めるプロトコルです.
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README
以下は原文 README の抜粋です。原文を見る。
Holy Bio MCP: A Unified MCP Framework for Bioinformatics Research
Developed during Bio x AI Hackathon 2025
🎯 Our Mission
Holy Bio MCP is a unified framework born during Bio x AI Hackathon-2025 from our practical experience building LLM-powered agents at the Longevity Genie project, IBIMA (Institute for Biostatistics and Informatics in Medicine and Ageing Research), and the Systems Biology of Aging Group. Our goal is to make life easier for researchers by providing a suite of specialized, interoperable tools that seamlessly integrate into AI-driven IDEs (like Cursor, Windsurf), chat clients (like Anthropic’s Claude Desktop), and serve as foundational building blocks for complex agentic workflows (using ElizaOS, Just-Agents, AutoGen, etc.).
This project aggregates several powerful, standalone MCP servers into a single, cohesive ecosystem for advanced bioinformatics and longevity research, including a native ElizaOS plugin for building autonomous research agents.
What is the Model Context Protocol (MCP)?
MCP is a protocol designed to bridge the gap between Large Language Models (LLMs) and specialized, domain-specific tools and databases. It provides a standardized way for AI assistants and agents to access complex functionalities through structured, type-safe interfaces.
If you want to understand MCP in more detail and learn how to use it effectively, we recommend these resources:
- DeepLearning.AI Course: MCP: Build Rich-Context AI Apps
- Official Documentation: Model Context Protocol Website
- Community: Search for “Model Context Protocol” on YouTube and other platforms for tutorials and discussions.
🔬 Real-World Example in Action
Here’s a real conversation (that you can easily reproduce yourself as all MCP-es are working and covered with tests) showing Holy Bio MCP servers working together to answer complex research questions, demonstrating the power of this integrated approach:
🎬 Video Demo
Here is a video demo of Holy-Bio-MCP, this time including synergistic genetic interventions and small molecules:
インストール
uvx --from biothings-mcp stdio設定
{
"mcpServers": {
"biothings-mcp": {
"command": "uvx",
"args": ["--from", "biothings-mcp", "stdio"]
},
"gget-mcp": {
"command": "uvx",
"args": ["gget-mcp", "stdio"]
},
"synergy-age-mcp": {
"command": "uvx",
"args": ["synergy-age-mcp"],
"env": {
"MCP_TRANSPORT": "stdio"
}
},
"opengenes-mcp": {
"command": "uvx",
"args": ["opengenes-mcp"],
"env": {
"MCP_TRANSPORT": "stdio"
}
},
"pharmacology-mcp": {
"command": "uvx",
"args": ["--from", "pharmacology-mcp", "stdio"]
}
}
}