これは、not ここに記述されているMCPをGossetです。 Gosset MCPにアクセスするには、アクティブなGossetアカウントが必要です。 詳しくはこちらをご覧ください。

生物医学的研究のためのモデルコンテキストプロトコル(MCP)サーバーの収集、AIアシスタントは、さまざまな生物医学データベースやリソースへのアクセスを提供します。

MCPとは?

モデルコンテキストプロトコル(MCP)は、ClaudeのようなAIアシスタントが外部ツールやデータソースにアクセスできるようにします。 これらのサーバーは、特定の生物医学データベースへのアクセスを提供し、Claudeの機能を拡張します。

利用可能なサーバー

このリポジトリには、次のMCPサーバーが含まれています。

PubMed MCP サーバー

生物医学文献の PubMed データベースにアクセスして下さい。

• クエリに合った記事を検索する PubMed
• 特定の記事の抽象的な取得
• PMIDに基づく関連記事を探す
• 特定の著者による記事を検索する

バイオRxiv/MedRxiv MCP サーバー

bioRxiv および medRxiv のリポジトリからアクセスのプレプリント。

• DOIによるプリプリントに関する詳細情報を入手
• 公開されたバージョンのプリプリントを見つける
• 最近のプレプリントを検索
• 日付範囲とカテゴリでプレビューを検索する

臨床トライアル.gov MCP サーバー

臨床試験に関する情報へのアクセス.

Biomedical public MCP Servers

This is not Gosset MCP as described here. For accessing Gosset MCP you need an active Gosset account. Reach out to us for details.

A collection of Model Context Protocol (MCP) servers for biomedical research, providing AI assistants with access to various biomedical databases and resources.

What is MCP?

The Model Context Protocol (MCP) allows AI assistants like Claude to access external tools and data sources. These servers extend Claude’s capabilities by providing access to specific biomedical databases.

Available Servers

This repository contains the following MCP servers:

PubMed MCP Server

Access the PubMed database of biomedical literature.

• Search PubMed for articles matching a query
• Retrieve abstracts for specific articles
• Find related articles based on a PMID
• Search for articles by a specific author

BioRxiv/MedRxiv MCP Server

Access preprints from bioRxiv and medRxiv repositories.

• Get detailed information about preprints by DOI
• Find published versions of preprints
• Search for recent preprints
• Search preprints by date range and category

ClinicalTrials.gov MCP Server

Access information about clinical trials.

• Search for trials matching specific criteria
• Get detailed information about specific trials
• Find trials by medical condition
• Find trials by location

DrugBank MCP Server

Access drug information from DrugBank.

• Search for drugs by name
• Get detailed information about specific drugs
• Find drugs by indication
• Find drugs by category
• Get drug interaction information

OpenTargets MCP Server

Access drug target information from Open Targets.

• Search for gene targets
• Get detailed target information
• Search for diseases
• Find disease-target associations
• Search for drugs

Setup

1. Install dependencies for all servers:

   pip install -r requirements.txt
   

2. For specific servers, additional setup may be required:

   • For PubMed: Update the EMAIL constant in pubmed_mcp.py with your email address (required by NCBI)
   • For DrugBank: Add your DrugBank API key to the API_KEY constant in drugbank_mcp.py

3. Run a server:

   python pubmed_mcp.py  # Replace with the server you want to run
   

Connecting to Claude for Desktop

To use these servers with Claude for Desktop:

1. Make sure you have the latest version of Claude for Desktop installed.

2. Edit your Claude for Desktop configuration file located at:

   • macOS: ~/Library/Application Support/Claude/claude_desktop_config.json
   • Windows: %AppData%\Claude\claude_desktop_config.json

3. Add server configurations:

   {
       "mcpServers": {
           "pubmed-mcp": {
               "command": "python",
               "args": [
                   "/ABSOLUTE/PATH/TO/pubmed_mcp.py"
               ]
           },
           "biorxiv-mcp": {