Это не Gosset MCP, как описано здесь. Для доступа к Gosset MCP вам нужна активная учетная запись Gosset. Обращайтесь к нам за подробностями.

Коллекция серверов Model Context Protocol (MCP) для биомедицинских исследований, предоставляющая помощникам ИИ доступ к различным биомедицинским базам данных и ресурсам.

Что такое MCP?

Протокол Model Context Protocol (MCP) позволяет помощникам ИИ, таким как Клод, получать доступ к внешним инструментам и источникам данных. Эти серверы расширяют возможности Клода, предоставляя доступ к конкретным биомедицинским базам данных.

Доступные серверы

Этот репозиторий содержит следующие MCP-серверы:

MCP-сервер

Доступ к базе данных PubMed биомедицинской литературы. Поиск PubMed для статей, соответствующих запросу

• Восстановление тезисов для конкретных статей Найти связанные статьи на основе PMID Поиск статей конкретного автора

BioRxiv/MedRxiv сервер

Доступ к препринтам из репозиториев bioRxiv и medRxiv. Получите подробную информацию о препринтах от DOI Найти опубликованные версии препринтов Поиск недавних препринтов

• Поиск препринтов по диапазону дат и категориям

###ClinicalTrials.gov MCP Server Доступ к информации о клинических испытаниях.

Biomedical public MCP Servers

This is not Gosset MCP as described here. For accessing Gosset MCP you need an active Gosset account. Reach out to us for details.

A collection of Model Context Protocol (MCP) servers for biomedical research, providing AI assistants with access to various biomedical databases and resources.

What is MCP?

The Model Context Protocol (MCP) allows AI assistants like Claude to access external tools and data sources. These servers extend Claude’s capabilities by providing access to specific biomedical databases.

Available Servers

This repository contains the following MCP servers:

PubMed MCP Server

Access the PubMed database of biomedical literature.

• Search PubMed for articles matching a query
• Retrieve abstracts for specific articles
• Find related articles based on a PMID
• Search for articles by a specific author

BioRxiv/MedRxiv MCP Server

Access preprints from bioRxiv and medRxiv repositories.

• Get detailed information about preprints by DOI
• Find published versions of preprints
• Search for recent preprints
• Search preprints by date range and category

ClinicalTrials.gov MCP Server

Access information about clinical trials.

• Search for trials matching specific criteria
• Get detailed information about specific trials
• Find trials by medical condition
• Find trials by location

DrugBank MCP Server

Access drug information from DrugBank.

• Search for drugs by name
• Get detailed information about specific drugs
• Find drugs by indication
• Find drugs by category
• Get drug interaction information

OpenTargets MCP Server

Access drug target information from Open Targets.

• Search for gene targets
• Get detailed target information
• Search for diseases
• Find disease-target associations
• Search for drugs

Setup

1. Install dependencies for all servers:

   pip install -r requirements.txt
   

2. For specific servers, additional setup may be required:

   • For PubMed: Update the EMAIL constant in pubmed_mcp.py with your email address (required by NCBI)
   • For DrugBank: Add your DrugBank API key to the API_KEY constant in drugbank_mcp.py

3. Run a server:

   python pubmed_mcp.py  # Replace with the server you want to run
   

Connecting to Claude for Desktop

To use these servers with Claude for Desktop:

1. Make sure you have the latest version of Claude for Desktop installed.

2. Edit your Claude for Desktop configuration file located at:

   • macOS: ~/Library/Application Support/Claude/claude_desktop_config.json
   • Windows: %AppData%\Claude\claude_desktop_config.json

3. Add server configurations:

   {
       "mcpServers": {
           "pubmed-mcp": {
               "command": "python",
               "args": [
                   "/ABSOLUTE/PATH/TO/pubmed_mcp.py"
               ]
           },
           "biorxiv-mcp": {