🔍 Дайте возможность AI-ассистентам искать, получать доступ и анализировать статьи PubMed через простой интерфейс MCP.

Сервер PubMed MCP служит мостом между ассистентами ИИ и обширным хранилищем биомедицинской литературы PubMed через протокол Model Context Protocol (MCP). Он позволяет моделям ИИ искать научные статьи, получать доступ к их метаданным и проводить глубокий анализ программно.

🤝 Внести вклад • 📝 Пожаловаться на ошибку

✨ Основные особенности

• 🔎 Поиск по бумаге: Запрос к статьям PubMed с ключевыми словами или расширенным поиском ✅
• 🚀 Эффективный поиск: быстрый доступ к бумажным метаданным ✅
• 📊 Доступ к метаданным: Получение подробных метаданных для конкретных статей ✅
• 📊 Поддержка исследований: содействие исследованиям и анализу ✅ в области биомедицинских наук
• 📄 Доступ к бумаге: попытка скачать полнотекстовый PDF-контент ✅
• 🧠 Глубокий анализ: проведение всестороннего анализа статей ✅
• 📝 Исследовательские подсказки: набор специализированных заданий для анализа ✅ статей

🚀 Быстрый старт

Требования

• Python 3.10+
• Библиотека FastMCP

Установка

Установка через Smithery

Чтобы автоматически установить pubmed-mcp-server для Claude Desktop через Smithery:

Клод

Курсор

PubMed MCP Server

🔍 Enable AI assistants to search, access, and analyze PubMed articles through a simple MCP interface.

The PubMed MCP Server provides a bridge between AI assistants and PubMed’s vast repository of biomedical literature through the Model Context Protocol (MCP). It allows AI models to search for scientific articles, access their metadata, and perform deep analysis in a programmatic way.

🤝 Contribute • 📝 Report Bug

✨ Core Features

• 🔎 Paper Search: Query PubMed articles with keywords or advanced search ✅
• 🚀 Efficient Retrieval: Fast access to paper metadata ✅
• 📊 Metadata Access: Retrieve detailed metadata for specific papers ✅
• 📊 Research Support: Facilitate biomedical sciences research and analysis ✅
• 📄 Paper Access: Attempt to download full-text PDF content ✅
• 🧠 Deep Analysis: Perform comprehensive analysis of papers ✅
• 📝 Research Prompts: A set of specialized prompts for paper analysis ✅

🚀 Quick Start

Prerequisites

• Python 3.10+
• FastMCP library

Installation

Installing via Smithery

To install pubmed-mcp-server for Claude Desktop automatically via Smithery:

claude

npx -y @smithery/cli install @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client claude

Cursor

Paste the following into Settings → Cursor Settings → MCP → Add new server:

• Mac/Linux

npx -y @smithery/cli@latest run @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client cursor --config "{}" 

Windsurf

npx -y @smithery/cli@latest install @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client windsurf --config "{}"

CLine

npx -y @smithery/cli@latest install @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client cline --config "{}"

1. Clone the repository:

   git clone https://github.com/JackKuo666/PubMed-MCP-Server.git
   cd PubMed-MCP-Server
   

2. Install the required dependencies:

   pip install -r requirements.txt
   

📊 Usage

Start the MCP server:

python pubmed_server.py

Usage with Claude Desktop

Add this configuration to your claude_desktop_config.json:

(Mac OS)

{
  "mcpServers": {
    "pubmed": {
      "command": "python",
      "args": ["-m", "pubmed-mcp-server"]
      }
  }
}

(Windows version):

{
  "mcpServers": {
    "pubmed": {
      "command": "C:\\Users\\YOUR\\PATH\\miniconda3\\envs\\mcp_server\\python.exe",
      "args": [
        "D:\\code\\YOUR\\PATH\\PubMed-MCP-Server\\pubmed_server.py"
      ],
      "env": {},
      "disabled": false,
      "autoApprove": []
    }
  }
}

Using with Cline

{
  "mcpServers": {
    "pubmed": {
      "command": "bash",
      "args": [
        "-c",