andybrandt/mcp-simple-pubmed
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andybrandt/mcp-simple-pubmed는 [[T0]에서 가져온 MCP 서버 후보입니다.
개요
andybrandt/mcp-simple-pubmed는 [[T0]에서 가져온 MCP 서버 후보입니다.
개요(AI 번역)
Entrez API를 통해 PubMed 문서에 접근할 수 있는 MCP 서버입니다.
특징
도구
- PubMed 검색 - 키워드, MeSH 용어, 저자명, 날짜 범위, 불리언 연산자를 사용하여 데이터베이스 검색
- 전체 텍스트 확인 - 가능하면 전체 텍스트 다운로드 (PubMed Central의 오픈 액세스 논문용)
- **추상록 접근 - 리소스 URI를 통해 문서 추상과 메타데이터를 조회합니다
프롬프트 (v0.1.14에 새롭게)
MCP 프롬프트는 효과적인 PubMed 검색 생성에 도움을 줍니다:
- 체계적 문헌고찰 검색 - MeSH 용어, 동의어, 날짜 필터를 활용한 종합 검색 전략 생성
- PICO 검색 - PICO 프레임워크(인구, 개입, 비교, 결과)를 사용하여 임상 질문 검색을 구축합니다.
- 저자 검색 - 특정 저자의 모든 출판물을 고유명 형식으로 찾을 수 있습니다
이 프롬프트들은 AI가 최적화된 PubMed 쿼리를 생성하도록 안내하여 철저한 문헌 검색을 쉽게 만듭니다.
주석
도구는 XML 기반 원본 텍스트를 반환한다는 점을 유의해 주세요.
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README
원문 README의 일부입니다. 원문 보기.
MCP Simple PubMed
An MCP server that provides access to PubMed articles through the Entrez API.
Features
Tools
- Search PubMed - Search the database using keywords, MeSH terms, author names, date ranges, and Boolean operators
- Get Full Text - Download full text when available (for open access articles in PubMed Central)
- Access Abstracts - Retrieve article abstracts and metadata via resource URIs
Prompts (New in v0.1.14)
MCP Prompts help you construct effective PubMed searches:
- Systematic Review Search - Generate comprehensive search strategies with MeSH terms, synonyms, and date filters for systematic reviews
- PICO Search - Build clinical question searches using the PICO framework (Population, Intervention, Comparison, Outcome)
- Author Search - Find all publications by a specific author with proper name formatting
These prompts guide the AI to build optimized PubMed queries, making it easier to conduct thorough literature searches.
Notes
Please note that the tool returns XML-ized version of full text. It is however more useful for AIs than a “human readable” text would have been as it gives them additional information about document’s structure. At least, this is what Claude 3.5 Sonnet said he prefers.
Please also note that inability of this tool and possibly other tools to deliver a paper’s full text may not be due to the fact that it is not available. When testing this tool I came across a paper that did not have full text on PubMed and when Claude accessed the publication URL (which we did get through DOI) using fetch he did get a "forbidden” error. However, I was able to access the very same page using a regular browser.
In other words if your AI assistant is not able to get the full text of a paper using this tool it is worth trying manually with a regular web browser.
Finally, this tool of course can’t give you access to paywalled/paid papers. You may be able to read them through your library access or – as a last resort – through a certain site that strives to make publicly funded research freely available.
Installation
Installing via Smithery
To install Simple PubMed for Claude Desktop automatically via Smithery:
npx -y @smithery/cli install mcp-simple-pubmed --client claude
Manual Installation
pip install mcp-simple-pubmed
설치
npx -y @smithery/cli install mcp-simple-pubmed --client claude설정
{
"mcpServers": {
"simple-pubmed": {
"command": "python",
"args": ["-m", "mcp_simple_pubmed"],
"env": {
"PUBMED_EMAIL": "[email protected]",
"PUBMED_API_KEY": "your-api-key"
}
}
}
}